發酵床養豬法不同于一般的傳統養豬，豬糞、尿可長期留存豬舍內，不向外排放，不向周圍流淌，整個育肥期不需要清除糞便，可采取在豬群出欄后一次性清除糞便，這樣做不會影響豬的發育。因為在豬的飼料和墊料中添加了微生物菌種，這樣有利于飼料中蛋白質的分解和轉化，降低糞便的臭味；同時在墊料發酵床內，墊料、糞尿、殘飼料是微生物源源不斷的營養食物，被不斷分解，所以床內見不到糞便垃圾臭哄哄的景象。
發酵床就象一個生態工廠，它總在不停地流水作業，墊料、豬糞尿、殘飼料等有機物通過發酵床內微生物菌這個"中樞"在循環轉化，微生物在"吃"墊料、豬糞尿、殘飼料，豬在"吃"微生物(包括各種真菌菌絲、菌體蛋白質、功能微生物的代謝產物、發酵分解出來的微量元素等等)，整個豬舍無廢料無殘留，無糞便垃圾產生，而且發酵床內部中心發酵時溫度可達60~70度，可殺死糞便中的蟲卵和病菌，清潔衛生，使蒼蠅蚊蟲失去了生存的基礎，所以在發酵床式豬舍內非常衛生干凈，很難見到蒼蠅，空氣清新，無異臭味。
